78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0247 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  96 
 
 		 375 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  77.31 
 
 		 373 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  77.71 
 
 		 373 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  71.75 
 
 		 385 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  69.21 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  59.5 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  59.78 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  58.56 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  58.13 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  55.29 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  55.5 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  58.1 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  57.82 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  57.82 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  53.26 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  50.84 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  50.84 
 
 		 368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  69.65 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  27.03 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  26.63 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  29.03 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  24.6 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  26.63 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  28.46 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  26.7 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  27.41 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  28.3 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  26.72 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  27.44 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  28.49 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  25.19 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  27.34 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  24.02 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  27.35 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  29.36 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  29.95 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  26.51 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  29.76 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  27.33 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  29.84 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  25.59 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  29.84 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  22.99 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  27.03 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  27.37 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  27.13 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  27.22 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  26.07 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  29.88 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  26.85 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  25.81 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  28.96 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  25.4 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  26.18 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  28.46 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  26.02 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.47 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  28.31 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  27.22 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  27.1 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  26.02 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  27.56 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  23.8 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  28.95 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  24.36 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  25.23 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  26.45 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  26.94 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  25.07 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  21.91 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 673 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 1162 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>