88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2532 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  751    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  94.81 
 
 
366 aa  717    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  62.78 
 
 
432 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  62.64 
 
 
367 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  59.83 
 
 
361 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  58.4 
 
 
362 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  58.86 
 
 
363 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  60.88 
 
 
375 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  58.29 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  56.53 
 
 
364 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  57.83 
 
 
368 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  57.51 
 
 
367 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  56.98 
 
 
363 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  58 
 
 
370 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  56.16 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  57.51 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  57.83 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  61.45 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  58.52 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  61.45 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  53.37 
 
 
366 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.77 
 
 
457 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  34.94 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  32.21 
 
 
374 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.11 
 
 
351 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  33.24 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  33.42 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  34.64 
 
 
362 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  34.62 
 
 
361 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  35.24 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  34.51 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.87 
 
 
372 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  34.66 
 
 
359 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  32.96 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  35.97 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  33.9 
 
 
358 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  33.62 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  31.93 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  34.88 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  33.24 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.53 
 
 
379 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  31.95 
 
 
389 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.75 
 
 
366 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  34.3 
 
 
382 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  34.33 
 
 
394 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.54 
 
 
371 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  31.55 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  34.3 
 
 
382 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  31.38 
 
 
373 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  33.72 
 
 
382 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25.31 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.93 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.3 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.74 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.65 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.44 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  26.72 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.73 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.26 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.84 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.19 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.02 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.13 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  21.43 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  24.66 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  21.43 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.88 
 
 
368 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.19 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  26.09 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  24.93 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.09 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  28.45 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.7 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  25.93 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  20.81 
 
 
331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  39.73 
 
 
569 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  34.94 
 
 
439 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  20.63 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.01 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  23.85 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  24.89 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27 
 
 
369 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
1162 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>