54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0936 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  765    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  34.89 
 
 		 1288 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  31.27 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30.56 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.7 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  29.17 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  24.32 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  33.72 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  32.38 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  24.62 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  32.38 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  31.13 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  23.31 
 
 		 333 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 673 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  28.31 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  24.86 
 
 		 638 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  27.38 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  27.22 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  27.86 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  35.63 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  23.48 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  30 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  32.97 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  31.91 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  28.49 
 
 		 432 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  31.33 
 
 		 591 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  26.44 
 
 		 447 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  32.22 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  27.16 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  32.22 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  29.63 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  30.23 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  27.38 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  30.49 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  27.47 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.05 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  32.53 
 
 		 649 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.49 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  29.27 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  27.71 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  26.13 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  30.67 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  27 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  23.43 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  26.63 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>