64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3024 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1303    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  45.71 
 
 		 424 aa  340  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  47.29 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  41.4 
 
 		 435 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  46.45 
 
 		 447 aa  283  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  43.07 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  27.21 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  26.62 
 
 		 325 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  27.08 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  27.08 
 
 		 331 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  27 
 
 		 331 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  26.9 
 
 		 333 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  26.25 
 
 		 331 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  26.67 
 
 		 331 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  31.34 
 
 		 322 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  25.86 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.48 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  25.5 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  35.96 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  21.92 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  35.96 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  41.04 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.29 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  36.52 
 
 		 569 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  40.91 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 1288 aa  60.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  27.08 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  27.81 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  37.63 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  39.29 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  31.48 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  25.7 
 
 		 352 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  34.09 
 
 		 394 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  23.48 
 
 		 694 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  39.77 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  31.48 
 
 		 394 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1162 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  40.43 
 
 		 626 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  26.44 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 1400 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  24.86 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  25.29 
 
 		 706 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  24.65 
 
 		 283 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.95 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 1737 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  23.86 
 
 		 2112 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  29.11 
 
 		 457 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  26.76 
 
 		 621 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  24.03 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  30.48 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  29.47 
 
 		 362 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  29.19 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  24.87 
 
 		 346 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.26 
 
 		 672 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  26.63 
 
 		 364 aa  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  34.45 
 
 		 579 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  28.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  21.75 
 
 		 685 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  23.1 
 
 		 388 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1049 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  30.91 
 
 		 648 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  22.35 
 
 		 1176 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>