67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2021 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  100 
 
 
435 aa  885    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  69.14 
 
 
442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  68.93 
 
 
448 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  62.71 
 
 
424 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  56.95 
 
 
447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  41.4 
 
 
638 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  29.17 
 
 
325 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  29.17 
 
 
325 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  29.41 
 
 
331 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  27.54 
 
 
331 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  29.29 
 
 
331 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  24.73 
 
 
325 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  29.03 
 
 
331 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  27.27 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  30.14 
 
 
331 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  28.7 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  26.18 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  31.46 
 
 
322 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  39.83 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
1400 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  27.08 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  39.47 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  36.79 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  38.18 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  36.94 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  35.71 
 
 
570 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  38.74 
 
 
649 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  25.44 
 
 
332 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  23.33 
 
 
706 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  34.81 
 
 
868 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  31.72 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  30.58 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  29.25 
 
 
352 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  30.83 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  25.26 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
1162 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.08 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
673 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
1288 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  22.65 
 
 
351 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  23.87 
 
 
1049 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.86 
 
 
369 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  27.92 
 
 
546 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
1737 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  22.22 
 
 
351 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  23.51 
 
 
694 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  33.54 
 
 
738 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.81 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  28.19 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  25.81 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  27.43 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  25.37 
 
 
685 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  29.3 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  22.61 
 
 
855 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  23.21 
 
 
171 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  22.76 
 
 
629 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.49 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  22.61 
 
 
855 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
1067 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  28.33 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  22.61 
 
 
854 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  25.07 
 
 
340 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  22.49 
 
 
366 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  29.12 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  26.4 
 
 
361 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  26.62 
 
 
352 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  27.92 
 
 
331 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>