58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0111 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  100 
 
 
394 aa  815    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  43.12 
 
 
558 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  40.91 
 
 
569 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  40.66 
 
 
570 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  39.4 
 
 
591 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  38.02 
 
 
649 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  32.16 
 
 
525 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  26.58 
 
 
394 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  27.22 
 
 
395 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  29.18 
 
 
490 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  29.47 
 
 
588 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  29.47 
 
 
620 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  27.32 
 
 
579 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  29.04 
 
 
604 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  37.38 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  38.18 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.42 
 
 
672 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  32.43 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  36.07 
 
 
868 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  31.48 
 
 
171 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.02 
 
 
322 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  30.77 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  32.08 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  32.17 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 
1288 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
1162 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
673 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  30.33 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  34.09 
 
 
638 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  32.69 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  29.92 
 
 
546 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
1737 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  28.81 
 
 
331 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  29.73 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  29.66 
 
 
331 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.81 
 
 
331 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  21.13 
 
 
331 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  28.81 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  30.23 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  29.66 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  25.26 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  33.82 
 
 
432 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  33.61 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  28.67 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
1087 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  33.96 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1103 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  31.58 
 
 
362 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  29.52 
 
 
1049 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  32.26 
 
 
362 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.37 
 
 
621 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  29.49 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  29.46 
 
 
363 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
1400 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  28.46 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  31.52 
 
 
366 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>