63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1889 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.33 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  25.87 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  38.37 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  30.77 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  31.03 
 
 		 439 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  29.31 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  28.15 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  29.82 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  24.65 
 
 		 638 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  37.23 
 
 		 587 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  35.24 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  27.92 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.01 
 
 		 558 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  41.94 
 
 		 432 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  29.22 
 
 		 570 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  29.31 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.86 
 
 		 376 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  21.67 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  30.94 
 
 		 649 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.94 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  34.62 
 
 		 361 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  33.03 
 
 		 374 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  34.62 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  28.05 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.59 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  30.77 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  26.24 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  32.2 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  26.24 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  30.53 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  38.27 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  37.97 
 
 		 394 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  37.04 
 
 		 394 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.55 
 
 		 376 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  28.8 
 
 		 694 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  30.95 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  29.13 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  21.13 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  25.81 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  30.95 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 1301 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  34.62 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  29.57 
 
 		 363 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  24.6 
 
 		 426 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  25.17 
 
 		 346 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  36.94 
 
 		 358 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  31.11 
 
 		 370 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  25.71 
 
 		 525 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>