78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1688 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  94.02 
 
 		 368 aa  707    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  57.02 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  55.98 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  56.44 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  55.43 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  51.93 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  53.5 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  51.93 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  53.31 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  53.31 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  53.31 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  53.99 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  52.75 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  51.52 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  50.84 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  51.4 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  51.57 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  46.2 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  49.48 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  29.33 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  26.16 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  27.73 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  27.6 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  26.74 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  26.96 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  26.02 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  28.81 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  25.75 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  24.38 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  24.53 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  24.61 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  25.67 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  23.56 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  25.2 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  27.88 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  24.4 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  23.58 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  23.18 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  24.09 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  27.55 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  26.02 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  24.02 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  32.96 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  23.9 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  25.3 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  22.89 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  23.88 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  25.7 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  23.53 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  26.39 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  27.03 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  24.09 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  24.55 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  24.35 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.43 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  29.02 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  24.3 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  25.58 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  25.58 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  23.64 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  24.61 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  24.09 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  23.24 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.24 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  25.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  27.49 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  24.02 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  24.24 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  24.68 
 
 		 694 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  25.23 
 
 		 1176 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  35.9 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 1162 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  25.82 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>