86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0505 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  87.23 
 
 		 376 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  78.14 
 
 		 371 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  79.33 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  80.45 
 
 		 369 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  72.07 
 
 		 382 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  71.51 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  61.1 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  58.62 
 
 		 351 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  58.05 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  56.66 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  55.14 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  62.79 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  62.5 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  58.86 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  60.28 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  61.05 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  58.43 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  58.75 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  58.46 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  50 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  50.7 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  51.66 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  53.46 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  51.11 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  48.6 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  44.13 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  49.3 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  47.63 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  49.3 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  44.82 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.67 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  35.64 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  35.77 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.86 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  35 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  33.61 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  34.22 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  34.17 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  35.14 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  33.61 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  34.49 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  36.51 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.05 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  36.19 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  33.81 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.56 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  31.28 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  31.56 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  36.34 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  36.26 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.22 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.64 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.78 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  29.89 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.76 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.95 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  28.65 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  25.75 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.46 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.13 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  28.45 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.27 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  24.59 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.5 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.5 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  33.03 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  38.75 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.91 
 
 		 569 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  30.32 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 673 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  31.43 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.36 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.93 
 
 		 868 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 1288 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  26.72 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  19.83 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  33.65 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  25.88 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  21.15 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>