80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2533 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  94.02 
 
 		 368 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  58.13 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  56.52 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  56.52 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  56.99 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  54.62 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  52.49 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  52.76 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  55.52 
 
 		 361 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  55.52 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  55.52 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  54.27 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  53.02 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  53.07 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  51.24 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  50.84 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  52.99 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  46.47 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  51.03 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  29.33 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  26.08 
 
 		 457 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.27 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  28.49 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  25.94 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  29.92 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  26.74 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  25.5 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  24.51 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  24.38 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  25.48 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  26.04 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  24.76 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  24.76 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  23.29 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  24.73 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  26.79 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  25.28 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  26.19 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  23.62 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  24.8 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  24.92 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  24.2 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  24.54 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  27.01 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  26.21 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  24.24 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  24.93 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  24.93 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  26.36 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  24.66 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  25.07 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  23.89 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  24.65 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  24.47 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  24.66 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  27.08 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  24.87 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25.54 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  25.47 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  31.07 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.58 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  23.67 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  23.58 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.88 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  25.8 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  23.5 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  25.34 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  26.09 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  26.74 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.84 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  20.55 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  26.46 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>