77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2167 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  97.35 
 
 		 358 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  86.74 
 
 		 358 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  68 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  67.81 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  62.04 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  59.77 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  62.94 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  60.72 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  53.74 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  61.76 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  58.86 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  58.86 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  53.74 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  62.07 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  59.77 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  60.59 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  59.62 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  53.91 
 
 		 389 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  54.02 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  48.99 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  48.43 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  47.74 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  45.28 
 
 		 362 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  44.44 
 
 		 457 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  43.27 
 
 		 361 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  48.01 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  42.2 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  45.53 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  44.38 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  45.24 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  36.75 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  35.2 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  35.18 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.01 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  34.64 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  35.18 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  35.69 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  34.77 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  35.23 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  37.18 
 
 		 367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.73 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  35.39 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.53 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.67 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.14 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.71 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  36.8 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  35.93 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  36.59 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35.75 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.14 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.8 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.39 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.22 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.41 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  27.2 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.59 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.33 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 1162 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.85 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.58 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.46 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.58 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.68 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  24.07 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.95 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.9 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.6 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  26.86 
 
 		 546 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  26.52 
 
 		 694 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.45 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  26.41 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>