83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0506 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  92.7 
 
 		 370 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  85.05 
 
 		 368 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  85.33 
 
 		 368 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  80.71 
 
 		 367 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  80.63 
 
 		 365 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  80.72 
 
 		 365 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  67.9 
 
 		 364 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  67.78 
 
 		 361 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  67.14 
 
 		 362 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  64.8 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  65.36 
 
 		 363 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  65.08 
 
 		 363 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  61.81 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  64.1 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  62.18 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  57.51 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  56.29 
 
 		 366 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  62.46 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  61.9 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  48.37 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  33.07 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  36.24 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  36.09 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  34.09 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.01 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  31.73 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.96 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  37.97 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.54 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  35.69 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  35.11 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  35.01 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.21 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  33.71 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  35.76 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.68 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  35 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.15 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.02 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  34.33 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.08 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  33.43 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  35.94 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  35.99 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.6 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.8 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.99 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  32.7 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  33.14 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  32.55 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  31.96 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  25.59 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.6 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.1 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.83 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.33 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  25.96 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  25 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.29 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.73 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.03 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  24.28 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  24.93 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.27 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  24.8 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.3 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.87 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 1288 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  32.22 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  25.14 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  27.7 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  28.57 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.11 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  31.16 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  36.61 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  24.05 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 1301 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>