81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0516 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  91.74 
 
 		 363 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  97.25 
 
 		 363 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  72.58 
 
 		 361 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  69.14 
 
 		 362 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  68.04 
 
 		 364 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  65.08 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  66.38 
 
 		 365 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  65.92 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  66.57 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  66.86 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  68.47 
 
 		 365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  64.79 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  64.1 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  58.57 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  58.29 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  63.38 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  63.48 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  65.01 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  64.14 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  50.27 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.36 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  37.75 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  38.31 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.29 
 
 		 457 aa  195  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  35.47 
 
 		 372 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  31.03 
 
 		 374 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  33.14 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.26 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.56 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.98 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  35.65 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  34.39 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.53 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.16 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  34.8 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  32.56 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  35.84 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.92 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.39 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  35.09 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.81 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  33.23 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  34.81 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.93 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  35.38 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.93 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  35.09 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.73 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  31.98 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  34.53 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  28.43 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.18 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.29 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.96 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  25.81 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.98 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  28.99 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.3 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  25.61 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.84 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  29.52 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  26.18 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  31.91 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  24.94 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.17 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.74 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  27.49 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 1288 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  31.03 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  29.74 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  26.89 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  41.33 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  34.18 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  28.93 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  34.88 
 
 		 569 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>