79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0515 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  97.35 
 
 		 358 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  86.46 
 
 		 358 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  67.43 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  68.09 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  62.32 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  59.71 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  62.94 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  54.31 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  58.57 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  62.06 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  59.61 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  54.31 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  58.57 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  59.77 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  61.49 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  60.59 
 
 		 382 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  54.89 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  59.29 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  53.63 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  48.7 
 
 		 374 aa  329  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  48.17 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  46.54 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  47.46 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  43.27 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  43.94 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  46.93 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  45.82 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  42.2 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  44.67 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  45.53 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.57 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  35.01 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  36.18 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  34.77 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  35.24 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  34.26 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  33.98 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  33.8 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.24 
 
 		 362 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.24 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.56 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  34.38 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  34.46 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.52 
 
 		 366 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  36.06 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  33.81 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  35.8 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  31.01 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  35.1 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  35.75 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  34.92 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.8 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.54 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.2 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.42 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.13 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.08 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 1162 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.46 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.36 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.03 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.69 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.47 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.88 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.89 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.6 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  24.18 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  24.02 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  26.21 
 
 		 546 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  26.29 
 
 		 694 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  26.25 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>