94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2776 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  70.88 
 
 
361 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  70.09 
 
 
362 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  68.04 
 
 
363 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  68.04 
 
 
363 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  67.49 
 
 
363 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  69.32 
 
 
370 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  67.9 
 
 
370 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  67.14 
 
 
368 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  66.57 
 
 
368 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  67.53 
 
 
365 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  65.24 
 
 
367 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  64.99 
 
 
365 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  60.27 
 
 
432 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  56.53 
 
 
366 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  56.53 
 
 
366 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  57.47 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  59.03 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  59.6 
 
 
375 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  58.74 
 
 
375 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  50.7 
 
 
366 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.41 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  34.75 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  34.08 
 
 
351 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  31.71 
 
 
374 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  35.69 
 
 
361 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  33.71 
 
 
457 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  37.07 
 
 
363 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  34.76 
 
 
363 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  34.94 
 
 
359 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.61 
 
 
393 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  37.5 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  33.71 
 
 
363 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  36.73 
 
 
358 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  33.53 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  36.15 
 
 
358 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  34.96 
 
 
358 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  34.38 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  33.61 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  34.88 
 
 
394 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  33.14 
 
 
358 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.93 
 
 
376 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.15 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  32.94 
 
 
366 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  32.94 
 
 
371 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  34.07 
 
 
373 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  33.61 
 
 
369 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  33.05 
 
 
386 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  32.1 
 
 
382 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  32.85 
 
 
382 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  32.46 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  32.46 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.88 
 
 
388 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.55 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  24.21 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.03 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  24.57 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.63 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.15 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  24.04 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.49 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.88 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.21 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.72 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.26 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.48 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  24.87 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.7 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  42.86 
 
 
546 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.01 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  20.2 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
1038 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.57 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  34.57 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  22.77 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 
1288 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  27.97 
 
 
569 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  26.63 
 
 
638 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  24.74 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  27.91 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
405 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.12 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.47 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  27.33 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  24.43 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  19.86 
 
 
2112 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  25.68 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  27.34 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  22.12 
 
 
424 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  24.59 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>