71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1746 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  100 
 
 
424 aa  861    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  62.71 
 
 
435 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  61.45 
 
 
442 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  59.81 
 
 
448 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  52.16 
 
 
447 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  45.71 
 
 
638 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  30.85 
 
 
325 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  31.14 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  30.5 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  28.12 
 
 
331 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  27.76 
 
 
331 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.52 
 
 
331 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  27.41 
 
 
331 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  26.42 
 
 
333 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  29.54 
 
 
525 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  27.37 
 
 
331 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.52 
 
 
353 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  23.96 
 
 
325 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  30.09 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  37.5 
 
 
591 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  24.84 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  28 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
673 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  36.19 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  37.38 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
1162 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  36.19 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  30.34 
 
 
570 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.4 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
1288 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  34.21 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
1400 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  24.93 
 
 
1049 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  37.17 
 
 
649 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  31.78 
 
 
558 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  26.46 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  24.59 
 
 
318 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  22.34 
 
 
706 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  29.5 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  24.35 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.22 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  23.21 
 
 
641 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  27.92 
 
 
283 aa  53.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  23.75 
 
 
629 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  37.18 
 
 
475 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  29.41 
 
 
621 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  22.97 
 
 
171 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  19.77 
 
 
854 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  19.77 
 
 
855 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  19.77 
 
 
855 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  25.09 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.31 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  22.32 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  28.14 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  21.97 
 
 
685 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  26.74 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  21.46 
 
 
694 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  23.82 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
1301 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  27.31 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.93 
 
 
672 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  22.06 
 
 
2112 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  21.46 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  26.89 
 
 
546 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
1737 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  31.65 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  19.01 
 
 
1176 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  22.54 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  35.63 
 
 
868 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  22.12 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>