104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1139 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  864    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  66.67 
 
 
367 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  63.64 
 
 
366 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  62.78 
 
 
366 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  68.07 
 
 
375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  63.59 
 
 
361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  60.27 
 
 
364 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  61.81 
 
 
370 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  62.85 
 
 
370 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  62.64 
 
 
368 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  67.51 
 
 
375 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  64.1 
 
 
363 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  62.02 
 
 
368 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  67.23 
 
 
375 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  63.82 
 
 
363 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  61.71 
 
 
367 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  64 
 
 
365 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  62.68 
 
 
363 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  59.83 
 
 
362 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  64.35 
 
 
365 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  53.31 
 
 
366 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  38.83 
 
 
457 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.62 
 
 
362 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.81 
 
 
359 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  37.57 
 
 
358 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  36.31 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  35.39 
 
 
363 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  32.47 
 
 
374 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  36.66 
 
 
363 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.96 
 
 
376 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.2 
 
 
351 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  37.12 
 
 
389 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  32.2 
 
 
351 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  37.32 
 
 
386 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  35.55 
 
 
358 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  35.09 
 
 
358 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  37.05 
 
 
358 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  37.33 
 
 
393 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  33.33 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  36.51 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.87 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  32.88 
 
 
363 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  37.1 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  34.58 
 
 
366 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  31.89 
 
 
376 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.75 
 
 
394 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  34.81 
 
 
371 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  33.43 
 
 
379 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.64 
 
 
373 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  35.94 
 
 
382 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  34.81 
 
 
369 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  35.36 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.25 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
372 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.63 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.96 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  28.54 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.86 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  24.73 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  27.6 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  36.36 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  25.85 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.13 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.23 
 
 
361 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  26.13 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  26.21 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  25.85 
 
 
325 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.24 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.18 
 
 
368 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.37 
 
 
361 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.44 
 
 
370 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.85 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.47 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  25.53 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.55 
 
 
322 aa  56.6  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  32.05 
 
 
569 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  24.06 
 
 
373 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  25.61 
 
 
331 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  25.61 
 
 
331 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  25 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  37.35 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  42.68 
 
 
546 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.82 
 
 
394 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  41.94 
 
 
283 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  25.61 
 
 
331 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  24.27 
 
 
373 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  28.49 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  31.85 
 
 
570 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  27.81 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  27.74 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  27.31 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  37.36 
 
 
587 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3899  hypothetical protein  26.36 
 
 
376 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
673 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  36.94 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  23.27 
 
 
382 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 
1288 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  29.06 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  30.5 
 
 
591 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>