91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2073 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  90.03 
 
 
365 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  80.72 
 
 
370 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  82.05 
 
 
368 aa  577  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  79.61 
 
 
370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  82.62 
 
 
368 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  82.3 
 
 
367 aa  557  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  67.05 
 
 
362 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  69.03 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  68.75 
 
 
363 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  68.47 
 
 
363 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  66.85 
 
 
363 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  64.99 
 
 
364 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  64.62 
 
 
432 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  65.93 
 
 
375 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  58.81 
 
 
366 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  58.52 
 
 
366 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  63.13 
 
 
367 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  66.86 
 
 
375 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  66 
 
 
375 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  48.88 
 
 
366 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  35.73 
 
 
374 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  38.27 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  38.59 
 
 
362 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  38.76 
 
 
457 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  38.64 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  37.64 
 
 
359 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  38.81 
 
 
363 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  36.06 
 
 
363 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  34.59 
 
 
361 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  37.03 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  32.19 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.01 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  34.2 
 
 
372 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  36.16 
 
 
376 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  35.41 
 
 
376 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  36.28 
 
 
358 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  36.55 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  34.92 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.99 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  37.93 
 
 
386 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  33.52 
 
 
358 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.85 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  36.09 
 
 
394 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  35.78 
 
 
382 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  34.43 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.61 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  35.96 
 
 
382 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.81 
 
 
394 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  35 
 
 
382 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  36.15 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  32.69 
 
 
369 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.77 
 
 
388 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  31.42 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  31.15 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  28.42 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  28.88 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  30.25 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  28.34 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  29.49 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.6 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  28.73 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.97 
 
 
385 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.25 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.86 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  28.14 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.38 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.85 
 
 
376 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.25 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  29.17 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  29.93 
 
 
558 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  33.58 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  33.86 
 
 
1288 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.99 
 
 
569 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.6 
 
 
331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.47 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.59 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.25 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.17 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.17 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  31.79 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  43.04 
 
 
546 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.53 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  31.68 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  21.59 
 
 
331 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.59 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  29.21 
 
 
591 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  29.87 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  34.94 
 
 
439 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>