48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2849 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1105    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  36.56 
 
 
587 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
673 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  30.83 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  31.51 
 
 
426 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  30.93 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  30.65 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
1162 aa  70.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  29.03 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  29.11 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
1087 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  27.37 
 
 
1049 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  38.37 
 
 
283 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
1103 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  40.51 
 
 
351 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  36.36 
 
 
374 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  40.51 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.52 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.92 
 
 
394 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  43.59 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  35.23 
 
 
376 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  42.68 
 
 
432 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  38 
 
 
569 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  41.56 
 
 
361 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.45 
 
 
388 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  34.04 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  34.04 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.95 
 
 
558 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  44.87 
 
 
359 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  40 
 
 
363 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  32.98 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 
1288 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  43.59 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  26.89 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  32.94 
 
 
376 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  32.58 
 
 
389 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  43.59 
 
 
394 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  44.16 
 
 
457 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  42.31 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  30.26 
 
 
591 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  38.16 
 
 
362 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  39.19 
 
 
366 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  31.82 
 
 
376 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  41.33 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  29.47 
 
 
385 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  32.18 
 
 
373 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  30.1 
 
 
370 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>