17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1954 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  703    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  56.97 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  53.64 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  50.91 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  29.24 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 673 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  30.93 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  28.35 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 1162 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  32.58 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6226  hypothetical protein  27.78 
 
 		 613 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.08261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1087 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  26.83 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6422  hypothetical protein  32.94 
 
 		 609 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>