42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0206 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  66.77 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  56.97 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  55.73 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  30.81 
 
 		 426 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 673 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  30.2 
 
 		 587 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1049 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  27.95 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 1162 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  26.67 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  30.56 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  32.52 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  32.52 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 536 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.19 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  33.66 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.26 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4989  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4812  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  40.79 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  30.29 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  32.97 
 
 		 570 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  31.03 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0303  putative glycosyl transferase  20.71 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0528  hypothetical protein  28.95 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0728399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.53 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.75 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  25.7 
 
 		 372 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  22.1 
 
 		 457 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  26.25 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  26.02 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.73 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>