70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1715 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  100 
 
 
570 aa  1178    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  55.11 
 
 
569 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  54.75 
 
 
649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  51.62 
 
 
591 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  47.54 
 
 
558 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  40.66 
 
 
394 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  31.58 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  28.64 
 
 
579 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.36 
 
 
395 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  22.68 
 
 
394 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  26.67 
 
 
604 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  29.06 
 
 
490 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  27.92 
 
 
620 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  27.64 
 
 
588 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  21.93 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
1162 aa  80.5  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.18 
 
 
672 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  30.34 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  37.8 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  21.7 
 
 
331 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  35.71 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  41.25 
 
 
1288 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  32.95 
 
 
353 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  40.91 
 
 
638 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  21.75 
 
 
333 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  21.97 
 
 
325 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
673 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  30.33 
 
 
331 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  31.76 
 
 
1049 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  21.94 
 
 
325 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  32.17 
 
 
359 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  28.77 
 
 
331 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  29.51 
 
 
331 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  33.67 
 
 
388 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.22 
 
 
283 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  37.36 
 
 
868 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  33.09 
 
 
432 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  37.8 
 
 
442 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  34.65 
 
 
322 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  26.55 
 
 
362 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1065  hypothetical protein  23.55 
 
 
412 aa  53.9  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  29.81 
 
 
457 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  28 
 
 
348 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
1737 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.71 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  29.36 
 
 
363 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  34.25 
 
 
317 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  26.19 
 
 
374 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.58 
 
 
379 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  29 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  29.21 
 
 
368 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  24.18 
 
 
171 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  32.22 
 
 
587 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  27.01 
 
 
325 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  27.84 
 
 
340 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  28.57 
 
 
641 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  28 
 
 
366 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  26.6 
 
 
332 aa  47  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  26.92 
 
 
376 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  34.72 
 
 
352 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
1400 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  29.25 
 
 
361 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  26.24 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  24.56 
 
 
363 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  36.45 
 
 
448 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  34.31 
 
 
358 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  28.74 
 
 
370 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  24.53 
 
 
475 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  26.97 
 
 
368 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  27.42 
 
 
694 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>