34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0378 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  727    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  32.77 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  31.94 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  31.14 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  29.31 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  30 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  25.86 
 
 		 638 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  30.15 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  28.7 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  27.23 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  25.71 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  28.82 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.82 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  26.09 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  24.39 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  25.6 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  28.04 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  29.2 
 
 		 591 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  25.68 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.58 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  25.87 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  27.61 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  27.14 
 
 		 525 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.18 
 
 		 558 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  24.05 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2113  hypothetical protein  31.37 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  0.405303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1438  hypothetical protein  21.93 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 1288 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49883  predicted protein  30.28 
 
 		 554 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0580309  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  23.91 
 
 		 810 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1162 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>