75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2228 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  24.52 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  24.86 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  27.98 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  22.48 
 
 
638 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  26.51 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  28.91 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.91 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  25.22 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  29.19 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  26.1 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  25.81 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.32 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  29.33 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  27.96 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  32.73 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  26.21 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  25.93 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.95 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  30.97 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  25.79 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  20.83 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  30.97 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  20.31 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  20.31 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  25.81 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  22.11 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  23.44 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  28.68 
 
 
569 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  23.38 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.08 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  28.26 
 
 
525 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  23.81 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.73 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
1162 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  24.18 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  24.73 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  24.18 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 
1288 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  41.77 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  32.95 
 
 
570 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  22.69 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  30.56 
 
 
591 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.73 
 
 
388 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  20.92 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  25.93 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  24.69 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  24.74 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  23.08 
 
 
368 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  19.43 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  22.58 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  21.67 
 
 
283 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
673 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  20.2 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  21.79 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.07 
 
 
649 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  26.55 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  19.8 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  29.41 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  23.03 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  27.03 
 
 
363 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49883  predicted protein  23.3 
 
 
554 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0580309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  24.72 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  22 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  23.77 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  19.67 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  28.21 
 
 
1049 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  23.08 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  25.64 
 
 
810 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  29.67 
 
 
389 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  24.31 
 
 
376 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  31.37 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>