83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1266 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  92.7 
 
 		 370 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  84.78 
 
 		 368 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  86.55 
 
 		 368 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  79.89 
 
 		 367 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  80.06 
 
 		 365 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  79.61 
 
 		 365 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  69.32 
 
 		 364 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  68.38 
 
 		 361 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  66.57 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  66.48 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  65.92 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  65.64 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  64 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  58 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  57.43 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  63.9 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  62.54 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  63.04 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  62.86 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  48.91 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  32.86 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  36.09 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.2 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  35.56 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  34.77 
 
 		 361 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  33.05 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  33.05 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.42 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  35.69 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  37.23 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  34.82 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.1 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.75 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  34.99 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  33.43 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  37.33 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  34.81 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.49 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.41 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  31.2 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  36.26 
 
 		 394 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.6 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.8 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  32.86 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  34.86 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.99 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  34.77 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  32.8 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  32.66 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  33.14 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.06 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  25.81 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.18 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.47 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.64 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.16 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.37 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  24.79 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.99 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  23.5 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.41 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.36 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  23.82 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.81 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  32.22 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.94 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.66 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  25.41 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  24.46 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 1288 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  27.4 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  30.43 
 
 		 558 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  28.91 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  23.68 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  23.68 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  38.94 
 
 		 525 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>