89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1690 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  96.3 
 
 		 351 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  61.49 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  57.76 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  58.91 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  59.88 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  53.74 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  56.13 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  58.15 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  58.7 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  58.7 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  55.75 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  56.32 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  56.32 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  50.57 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  53.47 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  54.52 
 
 		 386 aa  355  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  48.43 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  54.6 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  54.01 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  49.25 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  46.84 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  46.97 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  45.4 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  43.82 
 
 		 457 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  44.79 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  39.32 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  43.23 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  42.36 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  40.75 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  42.94 
 
 		 394 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.75 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  34.08 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  34.01 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  33.43 
 
 		 363 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  32.38 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  32.01 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  32.56 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  32.2 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  32.11 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  31.83 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  33.05 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  31.07 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  30.64 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  31.07 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  32.49 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  31.61 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  34.17 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  33.89 
 
 		 375 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  33.05 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  32.01 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.07 
 
 		 376 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.27 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  24.34 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  24.6 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  26.87 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.74 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.83 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  25.75 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.79 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.82 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  25.22 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  24.11 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  23.81 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  23.29 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.56 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.07 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  40.51 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  22.65 
 
 		 435 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.73 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 		 1162 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.46 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  22.32 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.46 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 673 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  21.76 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.78 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  34.57 
 
 		 439 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 1288 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  21.25 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  25.32 
 
 		 447 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  26.47 
 
 		 558 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>