94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3891 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  74.64 
 
 		 362 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  70.88 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  72.58 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  72.58 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  71.19 
 
 		 363 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  67.78 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  67.78 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  67.97 
 
 		 368 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  68.38 
 
 		 370 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  67.04 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  68.19 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  68.84 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  63.59 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  59.83 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  58.87 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  62.39 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  63.92 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  63.64 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  63.07 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  50.56 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  38.83 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  37.09 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  34.28 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  34.08 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  35.13 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  35.85 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  35.84 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  36.87 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.71 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.24 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  35.82 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  33.99 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.41 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  36.24 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  33.7 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  35.48 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  35.67 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  34.12 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  35.42 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  34.9 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.05 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  34.2 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.15 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.29 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.89 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.89 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  33.99 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  34.3 
 
 		 382 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  34.59 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  34.3 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25.35 
 
 		 388 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.66 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.17 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.3 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.52 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.25 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.83 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.37 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.3 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  24.8 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.37 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.6 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.53 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.09 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  23.41 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  23.65 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  26.92 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  21.74 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  41.56 
 
 		 546 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.14 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.27 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  36.9 
 
 		 591 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.86 
 
 		 558 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  29.05 
 
 		 649 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  28.67 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  31.73 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  27.46 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  27.31 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  27.66 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.17 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.17 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  37.35 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.9 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  25.59 
 
 		 694 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  26.02 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  35.14 
 
 		 525 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  18.7 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  22.49 
 
 		 2112 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  21.03 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>