66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1632 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  100 
 
 
569 aa  1164    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  61.24 
 
 
649 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  55.11 
 
 
570 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  52.5 
 
 
591 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  49.04 
 
 
558 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  40.91 
 
 
394 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  31.79 
 
 
525 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  29.02 
 
 
579 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  27.42 
 
 
604 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  29.1 
 
 
620 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  28.12 
 
 
490 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  26.67 
 
 
588 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.96 
 
 
325 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  22.71 
 
 
395 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  22.48 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 
1288 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.53 
 
 
672 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  39.83 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  31.72 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  26.03 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  32.93 
 
 
377 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1162 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  26.03 
 
 
331 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  26.03 
 
 
331 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  32.26 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  39.81 
 
 
868 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  31.45 
 
 
331 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  32.37 
 
 
359 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  36.52 
 
 
638 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  34.21 
 
 
424 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  28.68 
 
 
353 aa  61.6  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  30.08 
 
 
333 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1065  hypothetical protein  21.18 
 
 
412 aa  60.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.79 
 
 
379 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  28.85 
 
 
457 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  31.36 
 
 
442 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  32.05 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  28.15 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
1737 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  28.32 
 
 
1049 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  30.56 
 
 
388 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
673 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  30.56 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  29.5 
 
 
366 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3899  hypothetical protein  35.06 
 
 
376 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  32.04 
 
 
362 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  30.95 
 
 
171 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  29.76 
 
 
393 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  38 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  30.77 
 
 
363 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  31.13 
 
 
694 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  39.73 
 
 
366 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  36.44 
 
 
448 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  28.57 
 
 
394 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  27.96 
 
 
332 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.16 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  31.73 
 
 
361 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  28.57 
 
 
394 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  27.97 
 
 
364 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
1400 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  31.48 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  31.13 
 
 
375 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  26.94 
 
 
374 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>