66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1614 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  890    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  77.8 
 
 
448 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  69.14 
 
 
435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  61.45 
 
 
424 aa  498  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  55.1 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  47.29 
 
 
638 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  28.84 
 
 
325 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  28.84 
 
 
325 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  27.12 
 
 
331 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  28.83 
 
 
331 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.83 
 
 
331 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  27.84 
 
 
333 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  26.32 
 
 
331 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  29.58 
 
 
331 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  24.55 
 
 
325 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  29.31 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
1400 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  25.22 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  32.16 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  26.07 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  26.07 
 
 
351 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  34.23 
 
 
591 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  30.56 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  32.5 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.15 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
673 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  31.25 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  23.75 
 
 
317 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  31.09 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  23.44 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  26.35 
 
 
171 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.11 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  33.5 
 
 
741 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  31.36 
 
 
569 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  26.64 
 
 
346 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  36.02 
 
 
738 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  27.12 
 
 
318 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  40.16 
 
 
739 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  25 
 
 
1049 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  22.89 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  30.63 
 
 
558 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.73 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 
1288 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  26.67 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  37.8 
 
 
570 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  30.16 
 
 
649 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
1162 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  29.33 
 
 
365 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  21.13 
 
 
706 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  28.12 
 
 
359 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  25.11 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  30.99 
 
 
331 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  26.94 
 
 
340 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.14 
 
 
362 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.98 
 
 
672 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  25.83 
 
 
366 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  26.79 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  27.7 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  22.45 
 
 
694 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  24.87 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  29.09 
 
 
868 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  27.4 
 
 
370 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  25.68 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  25.6 
 
 
621 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
1067 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  26.04 
 
 
352 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>