17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0985 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  705    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  32.77 
 
 
348 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  34.14 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  30.33 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  26.46 
 
 
424 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.87 
 
 
442 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.12 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  27.47 
 
 
448 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.43 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  20.8 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  24.87 
 
 
638 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  27.59 
 
 
322 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  20.09 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  20.09 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2113  hypothetical protein  29.09 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  0.405303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  21.71 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  25.81 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>