81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0300 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  75.86 
 
 
442 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  100 
 
 
448 aa  905    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  69.05 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  60.14 
 
 
424 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  55.91 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  43.07 
 
 
638 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  30.34 
 
 
325 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  30.45 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  26.41 
 
 
331 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  25.9 
 
 
331 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  26.88 
 
 
331 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  26 
 
 
333 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  26.95 
 
 
331 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  24.92 
 
 
331 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  30.42 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
1400 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  32.13 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  26.21 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  23.27 
 
 
325 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  36.43 
 
 
591 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  38.39 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  24.33 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.33 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
1162 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  23.35 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  36.44 
 
 
569 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  30.91 
 
 
318 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  31.67 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  31.62 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  34.58 
 
 
558 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  27.78 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  28.57 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  25.32 
 
 
351 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  25.85 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  37.27 
 
 
649 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  28.23 
 
 
432 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  26.24 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
673 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  24.72 
 
 
1049 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  24.89 
 
 
366 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  28.71 
 
 
365 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  27.1 
 
 
346 aa  56.6  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  23.75 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  28.91 
 
 
370 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  27.22 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.78 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  28.28 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  36.11 
 
 
570 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  24.07 
 
 
340 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.35 
 
 
388 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  25.52 
 
 
171 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  28.64 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  24.22 
 
 
641 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
1103 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  28.02 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  24.39 
 
 
352 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  28.02 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  28.02 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.67 
 
 
672 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  30.28 
 
 
621 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  28.64 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  35 
 
 
1288 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
1067 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  33.91 
 
 
868 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  28.31 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  27.92 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.8 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  24.27 
 
 
374 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  26.94 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  28.35 
 
 
738 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
1737 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  31.5 
 
 
741 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  27.43 
 
 
546 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  29.67 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  21.74 
 
 
685 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  26.61 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  36.03 
 
 
739 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  21.92 
 
 
854 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  21.92 
 
 
855 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  21.92 
 
 
855 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  23.49 
 
 
694 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>