71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0456 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1103 aa  2246    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 		 1087 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0198  hypothetical protein  34.42 
 
 		 384 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0150  hypothetical protein  32.65 
 
 		 384 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0839  hypothetical protein  23.56 
 
 		 459 aa  103  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 673 aa  96.3  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2238  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.85 
 
 		 438 aa  77.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.1879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1049 aa  64.7  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0080  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  63.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1407  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.5 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 1162 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  24.89 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 3145 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.81 
 
 		 816 aa  55.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  18.49 
 
 		 1486 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  37.35 
 
 		 591 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 583 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 1737 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 573 aa  52  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  28.4 
 
 		 621 aa  52  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 486 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.85 
 
 		 267 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 634 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.89 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 1288 aa  49.3  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 824 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.02 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  38.57 
 
 		 395 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.59 
 
 		 725 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  38.57 
 
 		 394 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 416 aa  48.5  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.97 
 
 		 394 aa  48.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.13 
 
 		 880 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 909 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  32.63 
 
 		 448 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 681 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 750 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 708 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  29.21 
 
 		 332 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.17 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 542 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 565 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  24.07 
 
 		 331 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 377 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 828 aa  47.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  33.73 
 
 		 430 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.13 
 
 		 622 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 363 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 878 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 1013 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 637 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.53 
 
 		 887 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1106 aa  45.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30.97 
 
 		 364 aa  45.8  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 370 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.11 
 
 		 545 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 3301 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 435 aa  45.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.34 
 
 		 566 aa  45.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 828 aa  45.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 512 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  45.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.58 
 
 		 865 aa  45.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 208 aa  44.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 391 aa  44.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  44.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 833 aa  44.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  32.76 
 
 		 475 aa  44.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>