42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4156 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 		 364 aa  742    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1694 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 1759 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0113  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.44 
 
 		 594 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2416  hypothetical protein  28.53 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.256887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1690  hypothetical protein  28.71 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  28.37 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3424  hypothetical protein  28.26 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0286769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2237  hypothetical protein  31.13 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.720751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0664  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.32 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.637841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0707  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.78 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.645295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14500  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.64 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.321442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3544  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.03 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3931  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.92 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3696  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.48 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4514  hypothetical protein  25.38 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.11129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.18 
 
 		 588 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0114  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.1 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00033  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  26.73 
 
 		 586 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.93 
 
 		 946 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4206  CDP-glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family protein  27.97 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1840  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.76 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0248  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.69 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0300  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.54 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0242  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.69 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0998  teichoic acid biosynthesis protein B  19.22 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0887389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3578  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.41 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1103 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1805  hypothetical protein  26.25 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04062  CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family  30.22 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.29 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4474  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.41 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4279  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.41 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898994 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 856 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.71 
 
 		 941 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0198  hypothetical protein  27.9 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.65 
 
 		 1157 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  35.29 
 
 		 569 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1960  teichoic acid biosynthesis protein F  24.38 
 
 		 721 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1600  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.5 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.565675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0301  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.21 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>