18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1175    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  54.69 
 
 
586 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  46.11 
 
 
581 aa  342  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  43.7 
 
 
564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  44.58 
 
 
564 aa  333  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  44.04 
 
 
569 aa  309  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  41.05 
 
 
551 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36.69 
 
 
588 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  33.08 
 
 
608 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  36.14 
 
 
419 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  27.51 
 
 
458 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  27.51 
 
 
438 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.37 
 
 
364 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  26 
 
 
379 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  26 
 
 
379 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1435  hypothetical protein  24.63 
 
 
386 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1690  hypothetical protein  27.06 
 
 
389 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  25.5 
 
 
1694 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>