16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5666 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1152    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  48.81 
 
 
551 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  51.37 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  52.93 
 
 
564 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  38.7 
 
 
581 aa  339  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  44.01 
 
 
586 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  41.15 
 
 
576 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36 
 
 
588 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  35.94 
 
 
608 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  32.41 
 
 
419 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  26.52 
 
 
458 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  26.52 
 
 
438 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  26.39 
 
 
379 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  26.39 
 
 
379 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0664  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.57 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.637841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.29 
 
 
364 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>