15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1844 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1187    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  46.11 
 
 
576 aa  340  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  38 
 
 
569 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  42.64 
 
 
564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  44.14 
 
 
586 aa  319  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  42.37 
 
 
551 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  45.25 
 
 
564 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.32 
 
 
588 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  33.5 
 
 
608 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  29.64 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  25.71 
 
 
458 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  25.71 
 
 
438 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  30.14 
 
 
379 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  30.14 
 
 
379 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1435  hypothetical protein  22.68 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>