19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1843 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 
588 aa  1181    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  43.61 
 
 
586 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  39.75 
 
 
576 aa  286  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  38.57 
 
 
564 aa  263  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  37.3 
 
 
569 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  34.32 
 
 
581 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  39.51 
 
 
564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  37.47 
 
 
551 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  34.13 
 
 
608 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  30.99 
 
 
419 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  26.39 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  26.39 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  26.63 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  26.63 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4156  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.18 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188522  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1690  hypothetical protein  25.08 
 
 
389 aa  47.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1600  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.06 
 
 
395 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.565675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0094  hypothetical protein  32.37 
 
 
328 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8378  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  29.2 
 
 
931 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>