14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1678 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  93.26 
 
 
564 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1106    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  45.86 
 
 
569 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  42.53 
 
 
551 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  43.7 
 
 
576 aa  340  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  46.7 
 
 
586 aa  334  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  40.83 
 
 
581 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.57 
 
 
588 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  38.04 
 
 
608 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  31.27 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  25.14 
 
 
458 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  25.35 
 
 
438 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  25.17 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  25.17 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>