14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1683 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1107    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  93.26 
 
 		 564 aa  932    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  45.96 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  42.34 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  44.58 
 
 		 576 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  46.54 
 
 		 586 aa  329  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  41.18 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  37.14 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  36.12 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  31.27 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  26.59 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  26.59 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  25.17 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  25.17 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>