14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1219    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  37.82 
 
 
564 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  35.68 
 
 
569 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  35.49 
 
 
564 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  33.42 
 
 
581 aa  183  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  35.11 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  36.64 
 
 
586 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  32.71 
 
 
576 aa  161  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.74 
 
 
588 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  32.72 
 
 
419 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  27.51 
 
 
458 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  27.51 
 
 
438 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  23.18 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  23.18 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>