34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3683 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  725    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  37.31 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  26.26 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  28.52 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  28.52 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  25.7 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  28.14 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  26.69 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 1067 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  28 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  25.78 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  25.39 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 1400 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  26.03 
 
 		 638 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  29.95 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  20.75 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.67 
 
 		 442 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  23.3 
 
 		 641 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  23.94 
 
 		 855 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  23.94 
 
 		 854 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  23.94 
 
 		 855 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  26.55 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  23.75 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  23.02 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  38.89 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  23.35 
 
 		 706 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  26.6 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  29.63 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  32.46 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  29.73 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 1288 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  30.48 
 
 		 1498 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  28.42 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  30.4 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>