57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0963 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  910    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  56.95 
 
 
435 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  55.2 
 
 
442 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  55.66 
 
 
448 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  51.71 
 
 
424 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  46.45 
 
 
638 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  28.72 
 
 
325 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  30.71 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  30.8 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  30.38 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  32.2 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  30.62 
 
 
331 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  30.62 
 
 
331 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  25.5 
 
 
333 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  27.98 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  27.23 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.84 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
1400 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  29.47 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  22.66 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  36.11 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  24.43 
 
 
685 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  34.55 
 
 
525 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.96 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  25.27 
 
 
641 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.18 
 
 
672 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.44 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
1162 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  33.33 
 
 
569 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  34.71 
 
 
649 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  26.96 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  25.53 
 
 
694 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  25.32 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  26.6 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  26.64 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  25.21 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  23.84 
 
 
629 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  29.57 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  28.26 
 
 
388 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  29.57 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  30.84 
 
 
558 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
673 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.5 
 
 
621 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  35 
 
 
1288 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  26.17 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  24 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  26.44 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  23.46 
 
 
706 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  28.44 
 
 
331 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  21.89 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  36.59 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  27.72 
 
 
546 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  27.18 
 
 
364 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  24.74 
 
 
366 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
1103 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>