34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4076 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  46.34 
 
 
332 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  24.75 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.41 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  26.2 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  26.2 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
1288 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  24.34 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  38.89 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  25.66 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  23.45 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  33.33 
 
 
591 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  27.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  26.83 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  23.85 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  25.67 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.36 
 
 
672 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  30.23 
 
 
394 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  26.44 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  26.51 
 
 
447 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
1087 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
673 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.94 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.55 
 
 
558 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  22.43 
 
 
621 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  27.93 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  27.16 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  24.07 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  22.54 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  23.26 
 
 
490 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  27.84 
 
 
570 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.13 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  28.12 
 
 
649 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  27.16 
 
 
395 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>