40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1617 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  31.94 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  33.7 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  29.61 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  28.37 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  25.5 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  30.73 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  26.8 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  31.63 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  30.56 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  26.22 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  26.22 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  30.56 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.04 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.28 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  25.74 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  30.54 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  23.26 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  28.28 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  25.69 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  31.37 
 
 		 591 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.82 
 
 		 649 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 		 1288 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  36 
 
 		 570 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.56 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  23.3 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  24.75 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 673 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  25.48 
 
 		 868 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.59 
 
 		 569 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  32.53 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  21.05 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 1162 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  25.45 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.11 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  27.11 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  31.25 
 
 		 621 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  30.23 
 
 		 525 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  28.64 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 1087 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>