97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0958 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  85.67 
 
 
363 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  63.09 
 
 
362 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  63.31 
 
 
457 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  60.88 
 
 
359 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  59.32 
 
 
393 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  56.51 
 
 
379 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  58.19 
 
 
394 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  58.19 
 
 
394 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  49.03 
 
 
361 aa  329  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  48.77 
 
 
372 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  47.14 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  51.7 
 
 
376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  53.58 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  48.51 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  46.09 
 
 
363 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  51.27 
 
 
382 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  48.01 
 
 
358 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  44.63 
 
 
351 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  50.78 
 
 
386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  45.4 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  51.89 
 
 
382 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  51.57 
 
 
382 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  51.15 
 
 
366 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  47.66 
 
 
358 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  51.26 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  46.84 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  51.15 
 
 
371 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  47.37 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  46.02 
 
 
376 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  49.03 
 
 
369 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  38.42 
 
 
367 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  38.97 
 
 
363 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  38.03 
 
 
363 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  37.75 
 
 
363 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.13 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  35.51 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  36.91 
 
 
367 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  36.09 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  36.39 
 
 
368 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  35.39 
 
 
432 aa  195  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  37.54 
 
 
365 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.76 
 
 
364 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  35.64 
 
 
368 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  35.81 
 
 
370 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  37.39 
 
 
365 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  37.95 
 
 
375 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.15 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.42 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  38.06 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.96 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  38.23 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  29.27 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.82 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  28.49 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.18 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  27.6 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.03 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.91 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.68 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  28.31 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.56 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  28 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.25 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.01 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.67 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.58 
 
 
370 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  24.33 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.41 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  23.38 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  33.33 
 
 
558 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  31.87 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 
1288 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  21.37 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  35.63 
 
 
369 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.77 
 
 
569 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.07 
 
 
325 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  33.04 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  21.17 
 
 
325 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  21.76 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  21.76 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  40 
 
 
546 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  20.92 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
1162 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  32.46 
 
 
352 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  19.75 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  28.25 
 
 
629 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  26.96 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  24.87 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.46 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  25.95 
 
 
426 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.57 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>