88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1138 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  61.78 
 
 
351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  61.49 
 
 
351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  62.07 
 
 
358 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  61.49 
 
 
376 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  60.72 
 
 
382 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  61.1 
 
 
373 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  59.77 
 
 
366 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  60.67 
 
 
369 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  54.83 
 
 
363 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  59.49 
 
 
371 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  59 
 
 
382 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  53.26 
 
 
372 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  58.89 
 
 
386 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  58.69 
 
 
382 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  58.41 
 
 
382 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  53.78 
 
 
358 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  48.88 
 
 
374 aa  349  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  54.87 
 
 
358 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  54.57 
 
 
358 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  51.56 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  48.75 
 
 
359 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  48.08 
 
 
363 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  46.42 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  47.11 
 
 
363 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  42.98 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  42.58 
 
 
457 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  45.82 
 
 
393 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  45.82 
 
 
394 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  45.82 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  41.09 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  37.12 
 
 
432 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  36.24 
 
 
361 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  37.5 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  36.42 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  34.5 
 
 
367 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  35.01 
 
 
370 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  34.37 
 
 
368 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  34.96 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  34.08 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.46 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  33.99 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  33.71 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  32.86 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.29 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  32.61 
 
 
366 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  32.67 
 
 
366 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  35.98 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  34.95 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  35.58 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35.58 
 
 
375 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  34.92 
 
 
365 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  29.47 
 
 
376 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
372 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.86 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.44 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.81 
 
 
368 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.96 
 
 
375 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.49 
 
 
388 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.79 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.7 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.42 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.39 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.65 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.22 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  24.6 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.94 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.78 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.03 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.76 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  26.87 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  34.31 
 
 
546 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  27.27 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
1737 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  29.13 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  29.36 
 
 
569 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
1162 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  23.48 
 
 
694 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  23.4 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  25.64 
 
 
685 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  24.58 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  28.44 
 
 
591 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
374 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.56 
 
 
369 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  31.36 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>