84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1265 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  742    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  87.23 
 
 
373 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  80.82 
 
 
369 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  79.05 
 
 
366 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  79.33 
 
 
371 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  71.99 
 
 
382 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  72.01 
 
 
386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  57.76 
 
 
351 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  58.52 
 
 
363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  57.76 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  60.22 
 
 
389 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  61.65 
 
 
376 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  56.34 
 
 
372 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  62.5 
 
 
382 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  59.03 
 
 
358 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  62.5 
 
 
382 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  61.34 
 
 
382 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  60.24 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  59.25 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  60.18 
 
 
358 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  50.14 
 
 
374 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  49.59 
 
 
362 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  50.82 
 
 
363 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  50.97 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  52.75 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  48.46 
 
 
457 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  43.3 
 
 
361 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  49.86 
 
 
394 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  48.34 
 
 
393 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  45.1 
 
 
379 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  49.72 
 
 
394 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  36.17 
 
 
432 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.99 
 
 
361 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  35.81 
 
 
370 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  35.34 
 
 
362 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  35.71 
 
 
363 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.32 
 
 
370 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.38 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  34.16 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  34.62 
 
 
367 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.62 
 
 
363 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  31.75 
 
 
366 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  34.25 
 
 
368 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  36.53 
 
 
367 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  33.88 
 
 
368 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  35.62 
 
 
365 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  32.59 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.24 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  33.24 
 
 
365 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  36.46 
 
 
375 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  36.74 
 
 
375 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  36.19 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  29.6 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
372 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  22.08 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.56 
 
 
376 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  29.03 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  29.86 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.61 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  28.53 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.58 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  26.08 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.91 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.76 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.2 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.25 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.79 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.05 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  28.22 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  30.28 
 
 
558 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  31.82 
 
 
569 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.27 
 
 
369 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.69 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  29.05 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  32.76 
 
 
868 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  31.02 
 
 
322 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  31.73 
 
 
283 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.48 
 
 
377 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  24.68 
 
 
591 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.19 
 
 
649 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
1288 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>