92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5583 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  74.31 
 
 
361 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  69.13 
 
 
364 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  69.25 
 
 
363 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  68.7 
 
 
363 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  68.42 
 
 
363 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  67.61 
 
 
368 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  66.85 
 
 
370 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  67.33 
 
 
368 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  66.29 
 
 
370 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  66.67 
 
 
367 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  66.67 
 
 
365 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  67.24 
 
 
365 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  58.36 
 
 
366 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  57.79 
 
 
366 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  59.83 
 
 
432 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  59.6 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  60.06 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  60.06 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  59.5 
 
 
375 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  51.38 
 
 
366 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.16 
 
 
362 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  35.24 
 
 
351 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  33.05 
 
 
374 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  33.52 
 
 
351 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  35.18 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  33.43 
 
 
457 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  34.25 
 
 
359 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  35.91 
 
 
389 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  34.18 
 
 
363 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.97 
 
 
372 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  34.97 
 
 
358 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.48 
 
 
379 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  36.98 
 
 
363 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.34 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  32.7 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  34.19 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.14 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  33.14 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.85 
 
 
376 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  35.92 
 
 
386 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  33.62 
 
 
394 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.75 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  34.59 
 
 
382 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  32.12 
 
 
366 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  32.12 
 
 
371 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  33.52 
 
 
369 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  32.82 
 
 
373 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  34.3 
 
 
382 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  33.72 
 
 
382 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.3 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.06 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.06 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.62 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.25 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.51 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.37 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.2 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.72 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  25.53 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  25.41 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.67 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  24.87 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.13 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  24.6 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.86 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  26.3 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  25.97 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  25.33 
 
 
370 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  27.14 
 
 
171 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.74 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  29.29 
 
 
569 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  22.22 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  28.05 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  26.53 
 
 
558 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  26.79 
 
 
591 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.54 
 
 
442 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.26 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  25.1 
 
 
694 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.12 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  24.85 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  27.4 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  21.43 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.01 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  38.16 
 
 
546 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.01 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 
1288 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  25 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>