85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0245 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  98.36 
 
 		 371 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  78.69 
 
 		 376 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  79.33 
 
 		 373 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  76.88 
 
 		 369 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  69.53 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  70.85 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  58.19 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  56.61 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  59.77 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  56.32 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  61.92 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  60.47 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  54.93 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  60.67 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  58.43 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  57.02 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  59.64 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  59.35 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  56.38 
 
 		 376 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  49.18 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  49 
 
 		 362 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  50.42 
 
 		 359 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  46.78 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  48.03 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  45.28 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  47.9 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  47.12 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  44.72 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  46.09 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  47.77 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  33.89 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  35.11 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  34.81 
 
 		 432 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.29 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  34.93 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  34.54 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.65 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.54 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  32.08 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  34.53 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  35.38 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  33.15 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.24 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  33.43 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.9 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.8 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  34.67 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  35.03 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  35.36 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  34.07 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.65 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.8 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.61 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.79 
 
 		 376 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  29.95 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  29.01 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.65 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  28.18 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.43 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  29.22 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.6 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  28.1 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  28.88 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.32 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.9 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  30.28 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.47 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.92 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  28.25 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.97 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  35.45 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  34.55 
 
 		 649 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1049 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  32.74 
 
 		 1288 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  26.13 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  22.38 
 
 		 1162 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.36 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  25.71 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  25 
 
 		 591 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.44 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>