87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0437 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  718    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  79.44 
 
 		 370 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  89.47 
 
 		 365 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  81.2 
 
 		 368 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  78.61 
 
 		 370 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  81.48 
 
 		 368 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  78.93 
 
 		 367 aa  544  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  66.11 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  68.47 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  66.48 
 
 		 362 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  65.1 
 
 		 363 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  66.48 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  66.19 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  63.36 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  56.94 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  55.62 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  65.71 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  61.5 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  66 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  65.71 
 
 		 375 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  48.6 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  34.52 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  37.87 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.18 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.93 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  36.87 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  34.83 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  37.03 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  31.91 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  34.07 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  35.86 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  31.73 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  37.33 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  35.4 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  35.03 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.92 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  34.09 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  33.81 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.94 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  36.15 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.29 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  37.19 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  35.2 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  35.2 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  35.54 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  34.97 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  36.57 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  35.12 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.54 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.81 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.99 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  29.51 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  28.34 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  27.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.46 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  27.66 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  29.16 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.03 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.52 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.85 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  27.2 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.98 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.14 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  28.65 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 1288 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.8 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  33.66 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  26.65 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.42 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  31.86 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  29.33 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  19.8 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  25.6 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.79 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.01 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.27 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  28.71 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  26.11 
 
 		 591 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.45 
 
 		 558 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>